Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ERCC8Q13216 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ERCC8Q13216 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ERCC8Q13216 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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ERCC8Q13216 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ERCC8Q13216 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ERCC8Q13216 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ERCC8Q13216 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ERCC8Q13216 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ERCC8Q13216 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERCC8Q13216 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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