Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXF2Q12947 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms