Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF2Q12933 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF2Q12933 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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