Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TP53BP1Q12888 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TP53BP1Q12888 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms