Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SFSWAPQ12872 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFSWAPQ12872 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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