Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 MBB1YJL199C 327 nt2.93□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 RPS17AYML024W 411 nt2.93□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 FUN30YAL019W 3396 nt2.92□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 UBP14YBR058C 2346 nt2.92□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 PXA2YKL188C 2562 nt2.92□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 SGD1YLR336C 2700 nt2.92□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.92□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 YPL216WYPL216W 3309 nt2.91□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.91□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 snR76snR76 109 nt2.91□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.91□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 SRB8YCR081W 4284 nt2.91□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 PSK2YOL045W 3306 nt2.91□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 SNQ2YDR011W 4506 nt2.91□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 POL3YDL102W 3294 nt2.9□□□□□ -1.94
NSI1Q12457 COX14YML129C 213 nt2.9□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 RGM1YMR182C 636 nt2.9□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 RPL20AYMR242C 519 nt2.9□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt2.9□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 PTC5YOR090C 1719 nt2.9□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 INP2YMR163C 2118 nt2.89□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 RPL6AYML073C 531 nt2.89□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 ACM1YPL267W 630 nt2.89□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 BRP1YGL007W 378 nt2.88□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.88□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 RIF1YBR275C 5751 nt2.88□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 VPS34YLR240W 2628 nt2.88□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 DNL4YOR005C 2835 nt2.87□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 HAL9YOL089C 3093 nt2.87□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 SPC98YNL126W 2541 nt2.87□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 YLR149CYLR149C 2193 nt2.87□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 ATG13YPR185W 2217 nt2.87□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 snR72snR72 98 nt2.87□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 PNC1YGL037C 651 nt2.87□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 RAX2YLR084C 3663 nt2.87□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 APL5YPL195W 2799 nt2.86□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 RPL23BYER117W 414 nt2.86□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 ECM21YBL101C 3354 nt2.86□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 BUD4YJR092W 4344 nt2.86□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 YBT1YLL048C 4986 nt2.85□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 YIR044CYIR044C 186 nt2.85□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 EMC6YLL014W 327 nt2.85□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 VMA9YCL005W-A 222 nt2.85□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 EFR3YMR212C 2349 nt2.85□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 TFC4YGR047C 3078 nt2.84□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.84□□□□□ -1.95
NSI1Q12457 YIL169CYIL169C 2988 nt2.84□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 RLM1YPL089C 2031 nt2.83□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 ROG1YGL144C 2058 nt2.83□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 ORC1YML065W 2745 nt2.83□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 NOP10YHR072W-A 177 nt2.83□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.83□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 RPS12YOR369C 432 nt2.83□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YBR174CYBR174C 315 nt2.83□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 HRD3YLR207W 2502 nt2.83□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 PEP3YLR148W 2757 nt2.83□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 ESL1YIL151C 3357 nt2.82□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 PIG1YLR273C 1947 nt2.82□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.82□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YJL022WYJL022W 309 nt2.82□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 PMR1YGL167C 2853 nt2.82□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 RSE1YML049C 4086 nt2.82□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 SEF1YBL066C 3447 nt2.81□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YOR218CYOR218C 420 nt2.81□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YDR341CYDR341C 1824 nt2.81□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 TOR1YJR066W 7413 nt2.81□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 DUG2YBR281C 2637 nt2.81□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 GIS1YDR096W 2685 nt2.81□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 RGA2YDR379W 3030 nt2.81□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 SSN2YDR443C 4263 nt2.8□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 CAF120YNL278W 3183 nt2.8□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YJL120WYJL120W 324 nt2.8□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.8□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 DBP10YDL031W 2988 nt2.8□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 SPO14YKR031C 5052 nt2.8□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 GRR1YJR090C 3456 nt2.8□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 SPO22YIL073C 2928 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 SIR3YLR442C 2937 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 STB4YMR019W 2850 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YPR089WYPR089W 2667 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 FIR1YER032W 2631 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 GCV2YMR189W 3105 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 PMP2YEL017C-A 132 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 MCM10YIL150C 1716 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 KSP1YHR082C 3090 nt2.79□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 UBP11YKR098C 2154 nt2.78□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 PRP6YBR055C 2700 nt2.78□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 RGC1YPR115W 3252 nt2.78□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.78□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 YNL114CYNL114C 372 nt2.78□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 IRR1YIL026C 3453 nt2.78□□□□□ -1.96
NSI1Q12457 SAP1YER047C 2694 nt2.77□□□□□ -1.97
NSI1Q12457 RPH1YER169W 2391 nt2.77□□□□□ -1.97
NSI1Q12457 TCB2YNL087W 3537 nt2.77□□□□□ -1.97
NSI1Q12457 ZRG17YNR039C 1818 nt2.77□□□□□ -1.97
NSI1Q12457 SDC25YLL016W 3147 nt2.77□□□□□ -1.97
NSI1Q12457 NFT1YKR103W 3657 nt2.77□□□□□ -1.97
NSI1Q12457 VPH1YOR270C 2523 nt2.76□□□□□ -1.97
NSI1Q12457 MOT1YPL082C 5604 nt2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.1 ms