Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 NOP10YHR072W-A 177 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 HAL9YOL089C 3093 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 FIG4YNL325C 2640 nt2.85□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 SRP14YDL092W 441 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 RAD5YLR032W 3510 nt2.84□□□□□ -1.95
TY1A-NL1Q12391 DNL4YOR005C 2835 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 SET1YHR119W 3243 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 FMP16YDR070C 282 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 PAA1YDR071C 576 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 PHD1YKL043W 1101 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YLR282CYLR282C 342 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 RTT10YPL183C 3042 nt2.83□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 RPS25BYLR333C 327 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 RIC1YLR039C 3171 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 ENA2YDR039C 3276 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 ENA1YDR040C 3276 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 HRD3YLR207W 2502 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 INP52YNL106C 3552 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 ZRG17YNR039C 1818 nt2.82□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 UBP14YBR058C 2346 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YNL211CYNL211C 261 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 AHC1YOR023C 1701 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 AIM44YPL158C 2277 nt2.81□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 FUN30YAL019W 3396 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 SUL1YBR294W 2580 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 SWI5YDR146C 2130 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 STT4YLR305C 5703 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YCR043CYCR043C 384 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YJL120WYJL120W 324 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 RPL20AYMR242C 519 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YPL044CYPL044C 549 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 PRP6YBR055C 2700 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 ATP7YKL016C 525 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 MNE1YOR350C 1992 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 KAP123YER110C 3342 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 TAE2YPL009C 3117 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 SPO71YDR104C 3738 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 SPO14YKR031C 5052 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 UTP14YML093W 2700 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 SCH9YHR205W 2475 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 PAU3YCR104W 375 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 CMC4YMR194C-B 222 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 PTP3YER075C 2787 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 RRM3YHR031C 2172 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-NL1Q12391 YKU80YMR106C 1890 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 MNL2YLR057W 2550 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 OST4YDL232W 111 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 AKR1YDR264C 2295 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 FLO5YHR211W 3228 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 NMD2YHR077C 3270 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 PBY1YBR094W 2262 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 ARO1YDR127W 4767 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 ATG26YLR189C 3597 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 ENA5YDR038C 3276 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 YBR277CYBR277C 402 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 PMR1YGL167C 2853 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 YBT1YLL048C 4986 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 MAK21YDR060W 3078 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 CTF4YPR135W 2784 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 LYS14YDR034C 2373 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 APL5YPL195W 2799 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 YDL242WYDL242W 354 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 EMP24YGL200C 612 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 CDC31YOR257W 486 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 YCL046WYCL046W 324 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 PUT3YKL015W 2940 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 BUD4YJR092W 4344 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 YBR206WYBR206W 324 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 CRM1YGR218W 3255 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 MDM1YML104C 3384 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 STB4YMR019W 2850 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 SMC2YFR031C 3513 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 AFI1YOR129C 2682 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 PIP2YOR363C 2991 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 YDR186CYDR186C 2634 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 YIL174WYIL174W 228 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 EDS1YBR033W 2760 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 NOC3YLR002C 1992 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 TFC1YBR123C 1950 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 SMY2YBR172C 2223 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 TFC4YGR047C 3078 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-NL1Q12391 YFR016CYFR016C 3702 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 YDR239CYDR239C 2364 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 TSC11YER093C 4293 nt2.7□□□□□ -1.98
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