Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 TAE2YPL009C 3117 nt2.62□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 SPT21YMR179W 2277 nt2.61□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YIL174WYIL174W 228 nt2.61□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 INA22YIR024C 651 nt2.61□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YJL135WYJL135W 318 nt2.61□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.61□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 CRS5YOR031W 210 nt2.61□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 PLC1YPL268W 2610 nt2.61□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 UTP14YML093W 2700 nt2.61□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 ECM29YHL030W 5607 nt2.6□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YLR278CYLR278C 4026 nt2.6□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 PEP3YLR148W 2757 nt2.6□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YDR286CYDR286C 345 nt2.6□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 SUL1YBR294W 2580 nt2.6□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 IKI3YLR384C 4050 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YKU70YMR284W 1809 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 SDH6YDR379C-A 240 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YPR092WYPR092W 306 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YPR203WYPR203W 309 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 YDR186CYDR186C 2634 nt2.59□□□□□ -1.99
UPC2Q12151 RGA2YDR379W 3030 nt2.59□□□□□ -2
UPC2Q12151 RIC1YLR039C 3171 nt2.59□□□□□ -2
UPC2Q12151 KAP123YER110C 3342 nt2.58□□□□□ -2
UPC2Q12151 SEC5YDR166C 2916 nt2.58□□□□□ -2
UPC2Q12151 PHO2YDL106C 1680 nt2.58□□□□□ -2
UPC2Q12151 PNC1YGL037C 651 nt2.58□□□□□ -2
UPC2Q12151 INP2YMR163C 2118 nt2.58□□□□□ -2
UPC2Q12151 GEA1YJR031C 4227 nt2.58□□□□□ -2
UPC2Q12151 VPS16YPL045W 2397 nt2.57□□□□□ -2
UPC2Q12151 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.57□□□□□ -2
UPC2Q12151 PXA2YKL188C 2562 nt2.57□□□□□ -2
UPC2Q12151 VPS54YDR027C 2670 nt2.56□□□□□ -2
UPC2Q12151 MUK1YPL070W 1839 nt2.56□□□□□ -2
UPC2Q12151 RPL42BYHR141C 321 nt2.56□□□□□ -2
UPC2Q12151 RPL42AYNL162W 321 nt2.56□□□□□ -2
UPC2Q12151 YBR277CYBR277C 402 nt2.56□□□□□ -2
UPC2Q12151 JSN1YJR091C 3276 nt2.56□□□□□ -2
UPC2Q12151 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.55□□□□□ -2
UPC2Q12151 AFI1YOR129C 2682 nt2.55□□□□□ -2
UPC2Q12151 YOR376WYOR376W 369 nt2.55□□□□□ -2
UPC2Q12151 SWI6YLR182W 2412 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 CYR1YJL005W 6081 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 YIL080WYIL080W 4722 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 SRB8YCR081W 4284 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 FLO11YIR019C 4104 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 MRP10YDL045W-A 288 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 YGL217CYGL217C 342 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 ACB1YGR037C 264 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 YNL205CYNL205C 423 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 RPB10YOR210W 213 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 NFT1YKR103W 3657 nt2.54□□□□□ -2
UPC2Q12151 SCH9YHR205W 2475 nt2.53□□□□□ -2
UPC2Q12151 BNR1YIL159W 4128 nt2.53□□□□□ -2
UPC2Q12151 AMS1YGL156W 3252 nt2.53□□□□□ -2
UPC2Q12151 CRM1YGR218W 3255 nt2.53□□□□□ -2
UPC2Q12151 MNL2YLR057W 2550 nt2.53□□□□□ -2
UPC2Q12151 YGR050CYGR050C 357 nt2.53□□□□□ -2
UPC2Q12151 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.53□□□□□ -2
UPC2Q12151 SNC1YAL030W 354 nt2.53□□□□□ -2
UPC2Q12151 SWR1YDR334W 4545 nt2.52□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 RRP6YOR001W 2202 nt2.52□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 snR74snR74 88 nt2.52□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YNL114CYNL114C 372 nt2.52□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 INP51YIL002C 2841 nt2.52□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 PFF1YBR074W 2931 nt2.52□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 HOS4YIL112W 3252 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 CAF120YNL278W 3183 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 SAP1YER047C 2694 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YER138CYER138C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YER160CYER160C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YJR027WYJR027W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YML039WYML039W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YML045WYML045W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YMR050CYMR050C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 snR43snR43 209 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 RPH1YER169W 2391 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 STB4YMR019W 2850 nt2.51□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 INP53YOR109W 3324 nt2.5□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 SPO22YIL073C 2928 nt2.5□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 VMR1YHL035C 4779 nt2.5□□□□□ -2.01
UPC2Q12151 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms