Protein–RNA interactions for Protein: Q12072

IOC2, ISWI one complex protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IOC2Q12072 DIA2YOR080W 2199 nt3.95□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 CAF130YGR134W 3369 nt3.94□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 YLR416CYLR416C 399 nt3.94□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 YLR352WYLR352W 2424 nt3.94□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 SEF1YBL066C 3447 nt3.93□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 TMA17YDL110C 453 nt3.93□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 YNR065CYNR065C 3351 nt3.93□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 TFC1YBR123C 1950 nt3.93□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 ASE1YOR058C 2658 nt3.92□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 NUP120YKL057C 3114 nt3.92□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 SQS1YNL224C 2304 nt3.92□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 SET2YJL168C 2202 nt3.91□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 RPL23BYER117W 414 nt3.91□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt3.91□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 FAR1YJL157C 2493 nt3.9□□□□□ -1.78
IOC2Q12072 BIR1YJR089W 2865 nt3.9□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 PUT3YKL015W 2940 nt3.9□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt3.89□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 SCH9YHR205W 2475 nt3.89□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 APL4YPR029C 2499 nt3.89□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 RPH1YER169W 2391 nt3.89□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 ORC3YLL004W 1851 nt3.88□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 RPS23BYPR132W 438 nt3.88□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 RAD26YJR035W 3258 nt3.88□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 PSK2YOL045W 3306 nt3.88□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 MPH1YIR002C 2982 nt3.87□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 YAT2YER024W 2772 nt3.87□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 APE2YKL157W 2859 nt3.87□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 YMR31YFR049W 372 nt3.87□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 MAD1YGL086W 2250 nt3.87□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 EXO84YBR102C 2262 nt3.87□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.86□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 RPS12YOR369C 432 nt3.86□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 MTC4YBR255W 2085 nt3.86□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 RPO21YDL140C 5202 nt3.86□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 SVL3YPL032C 2478 nt3.85□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.85□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.85□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 GLC3YEL011W 2115 nt3.85□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 UBP14YBR058C 2346 nt3.84□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.84□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.84□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt3.84□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 MYO3YKL129C 3819 nt3.84□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 YCG1YDR325W 3108 nt3.84□□□□□ -1.79
IOC2Q12072 LOS1YKL205W 3303 nt3.83□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YDL206WYDL206W 2289 nt3.83□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 VPS35YJL154C 2835 nt3.83□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 SPT4YGR063C 309 nt3.83□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.83□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YKU80YMR106C 1890 nt3.82□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt3.82□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 ACB1YGR037C 264 nt3.82□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.82□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 HFM1YGL251C 3564 nt3.82□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 TTI1YKL033W 3117 nt3.82□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YPL150WYPL150W 2706 nt3.82□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YBR225WYBR225W 2703 nt3.82□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 PRP22YER013W 3438 nt3.82□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 ALA1YOR335C 2877 nt3.81□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YPP1YGR198W 2454 nt3.81□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 PHM6YDR281C 315 nt3.81□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 MMS4YBR098W 2076 nt3.81□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 NOP9YJL010C 2001 nt3.81□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 LHS1YKL073W 2646 nt3.81□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 ARO80YDR421W 2853 nt3.81□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 SEC1YDR164C 2175 nt3.8□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 COG6YNL041C 2520 nt3.8□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 OSH3YHR073W 2991 nt3.8□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YLL020CYLL020C 306 nt3.8□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 RSM19YNR037C 276 nt3.8□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.8□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 CPA2YJR109C 3357 nt3.8□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 COP1YDL145C 3606 nt3.8□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 HEF3YNL014W 3135 nt3.79□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 SKP2YNL311C 2292 nt3.79□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 FLO10YKR102W 3510 nt3.79□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt3.79□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 RGM1YMR182C 636 nt3.79□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 TIM12YBR091C 330 nt3.79□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 RTT107YHR154W 3213 nt3.78□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 KAP120YPL125W 3099 nt3.78□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.78□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 BNI4YNL233W 2679 nt3.78□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 URA2YJL130C 6645 nt3.78□□□□□ -1.8
IOC2Q12072 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 VID27YNL212W 2349 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 USA1YML029W 2517 nt3.77□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 SAK1YER129W 3429 nt3.76□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 INP53YOR109W 3324 nt3.76□□□□□ -1.81
IOC2Q12072 SNT1YCR033W 3681 nt3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45 ms