Protein–RNA interactions for Protein: Q08641

ABP140, tRNA(Thr) (cytosine(32)-N(3))-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ABP140Q08641 NBP1YLR457C 960 nt0.89□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 SPC2YML055W 537 nt0.89□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 RPS30BYOR182C 192 nt0.89□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 VPS52YDR484W 1926 nt0.89□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 CDC39YCR093W 6327 nt0.88□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 TAD1YGL243W 1203 nt0.88□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.88□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 IRC23YOR044W 474 nt0.88□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 VAM3YOR106W 852 nt0.88□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 KAP120YPL125W 3099 nt0.88□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YCS4YLR272C 3531 nt0.88□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 OST1YJL002C 1431 nt0.88□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 COX7YMR256C 183 nt0.87□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.87□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YPR170CYPR170C 336 nt0.87□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 SAS3YBL052C 2496 nt0.87□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.86□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 SMB1YER029C 591 nt0.86□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.86□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 MRPS8YMR158W 468 nt0.86□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.86□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 SWS2YNL081C 432 nt0.86□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 NUP145YGL092W 3954 nt0.86□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 HDA3YPR179C 1968 nt0.86□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 APL3YBL037W 3078 nt0.85□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 GPM2YDL021W 936 nt0.85□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 snR79snR79 84 nt0.85□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YGL230CYGL230C 444 nt0.85□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.85□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YGR115CYGR115C 780 nt0.84□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YHR054CYHR054C 1065 nt0.84□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 INA22YIR024C 651 nt0.84□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YPT6YLR262C 648 nt0.84□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.84□□□□□ -2.27
ABP140Q08641 MPC1YGL080W 393 nt0.83□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YPL197CYPL197C 414 nt0.83□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 BI4Q0120 1917 nt0.82□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 ZIP1YDR285W 2628 nt0.82□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 LRP1YHR081W 555 nt0.82□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YKL111CYKL111C 336 nt0.82□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.82□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.82□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 NOC3YLR002C 1992 nt0.81□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 SWI5YDR146C 2130 nt0.81□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 TIM10YHR005C-A 282 nt0.81□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 POP7YBR167C 423 nt0.81□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 NUT1YGL151W 3399 nt0.81□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 AIM9YER080W 1884 nt0.8□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 COG4YPR105C 2586 nt0.8□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 TOF2YKR010C 2316 nt0.8□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YCR100CYCR100C 951 nt0.8□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 NHP2YDL208W 471 nt0.8□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YDR220CYDR220C 294 nt0.8□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YGL109WYGL109W 324 nt0.8□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 MPT5YGL178W 2580 nt0.8□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 SEC1YDR164C 2175 nt0.79□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 SRP14YDL092W 441 nt0.79□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YDL152WYDL152W 366 nt0.79□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.79□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YOP1YPR028W 543 nt0.79□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 AIM44YPL158C 2277 nt0.78□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 snR5snR5 204 nt0.78□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 SEM1YDR363W-A 270 nt0.78□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YDR521WYDR521W 336 nt0.78□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 CYC7YEL039C 342 nt0.78□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 SDS22YKL193C 1017 nt0.78□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.78□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 YBR012CYBR012C 420 nt0.78□□□□□ -2.28
ABP140Q08641 UTP13YLR222C 2454 nt0.77□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.77□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 SLX9YGR081C 633 nt0.77□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 NBL1YHR199C-A 222 nt0.77□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 RPL16AYIL133C 600 nt0.77□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 CMC4YMR194C-B 222 nt0.77□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.77□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YJR003CYJR003C 1560 nt0.77□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 NUP157YER105C 4176 nt0.76□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 RIM20YOR275C 1986 nt0.76□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.76□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YGL015CYGL015C 393 nt0.76□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.76□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 PIG1YLR273C 1947 nt0.76□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 HNT1YDL125C 477 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YGR045CYGR045C 363 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YGR228WYGR228W 345 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YAP3YHL009C 993 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YBR063CYBR063C 1215 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 YPR096CYPR096C 303 nt0.75□□□□□ -2.29
ABP140Q08641 QCR7YDR529C 384 nt0.74□□□□□ -2.29
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