Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACTN3Q08043 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACTN3Q08043 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms