Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD51Q06609 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD51Q06609 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms