Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSME1Q06323 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PSME1Q06323 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms