Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALD1Q05682 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms