Protein–RNA interactions for Protein: Q04749

AVO2, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO2, yeastyeast

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO2Q04749 CWC23YGL128C 852 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 TIM10YHR005C-A 282 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YKL111CYKL111C 336 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 PAU18YLL064C 363 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SWS2YNL081C 432 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 PAU6YNR076W 363 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YPL197CYPL197C 414 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YPR170CYPR170C 336 nt0.62□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 STB6YKL072W 2301 nt0.61□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 NOC3YLR002C 1992 nt0.61□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 AIM44YPL158C 2277 nt0.61□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 MRPL32YCR003W 552 nt0.61□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 NHP2YDL208W 471 nt0.61□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SNO3YFL060C 669 nt0.61□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SNO2YNL334C 669 nt0.61□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 POP7YBR167C 423 nt0.61□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SAS3YBL052C 2496 nt0.6□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.6□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 COX7YMR256C 183 nt0.6□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.6□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 NUT1YGL151W 3399 nt0.6□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SWI5YDR146C 2130 nt0.59□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 TOF2YKR010C 2316 nt0.59□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YGL015CYGL015C 393 nt0.59□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 LRP1YHR081W 555 nt0.59□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 SDS22YKL193C 1017 nt0.59□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.59□□□□□ -2.31
AVO2Q04749 APL3YBL037W 3078 nt0.59□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 UTP13YLR222C 2454 nt0.59□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 MPT5YGL178W 2580 nt0.58□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 RIM20YOR275C 1986 nt0.58□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YDL152WYDL152W 366 nt0.58□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YDR521WYDR521W 336 nt0.58□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YHR054CYHR054C 1065 nt0.58□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 IRC23YOR044W 474 nt0.58□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 snR5snR5 204 nt0.57□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 RTT102YGR275W 474 nt0.57□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 ANS1YHR126C 480 nt0.57□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 VAM3YOR106W 852 nt0.57□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YBR012CYBR012C 420 nt0.57□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YOP1YPR028W 543 nt0.57□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YDR220CYDR220C 294 nt0.56□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.56□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YGR228WYGR228W 345 nt0.56□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 RPL16AYIL133C 600 nt0.56□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 CMC4YMR194C-B 222 nt0.56□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 AIM9YER080W 1884 nt0.56□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 GUP1YGL084C 1683 nt0.56□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 CDC24YAL041W 2565 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 GPM2YDL021W 936 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 CYC7YEL039C 342 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YGR045CYGR045C 363 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YLR366WYLR366W 306 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YBR071WYBR071W 636 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YPR096CYPR096C 303 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YCL002CYCL002C 792 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 PIG1YLR273C 1947 nt0.55□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.54□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YAP3YHL009C 993 nt0.54□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 NBL1YHR199C-A 222 nt0.54□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 BMT5YIL096C 1011 nt0.54□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.54□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 NUT2YPR168W 474 nt0.54□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 SHE9YDR393W 1371 nt0.54□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 PXA2YKL188C 2562 nt0.53□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 SRP14YDL092W 441 nt0.53□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 HNT1YDL125C 477 nt0.53□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YDR114CYDR114C 303 nt0.53□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YEL057CYEL057C 702 nt0.53□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 RPC10YHR143W-A 213 nt0.53□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 NUP157YER105C 4176 nt0.53□□□□□ -2.32
AVO2Q04749 YDL206WYDL206W 2289 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 MKT1YNL085W 2493 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 QCR7YDR529C 384 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YLR271WYLR271W 825 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YPR099CYPR099C 357 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 CDC39YCR093W 6327 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 PAN3YKL025C 2040 nt0.52□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 SEM1YDR363W-A 270 nt0.51□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 SET3YKR029C 2256 nt0.5□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 SCW11YGL028C 1629 nt0.5□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 snR9snR9 187 nt0.5□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.5□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 SDH2YLL041C 801 nt0.5□□□□□ -2.33
AVO2Q04749 CSM4YPL200W 471 nt0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.6 ms