Protein–RNA interactions for Protein: Q04739

GAL83, SNF1 protein kinase subunit beta-3, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GAL83Q04739 NUP145YGL092W 3954 nt0.72□□□□□ -2.29
GAL83Q04739 SMB1YER029C 591 nt0.72□□□□□ -2.29
GAL83Q04739 YGR115CYGR115C 780 nt0.72□□□□□ -2.29
GAL83Q04739 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.72□□□□□ -2.29
GAL83Q04739 YPT6YLR262C 648 nt0.72□□□□□ -2.29
GAL83Q04739 YPR147CYPR147C 915 nt0.72□□□□□ -2.29
GAL83Q04739 HDA3YPR179C 1968 nt0.72□□□□□ -2.29
GAL83Q04739 MRPL32YCR003W 552 nt0.71□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 snR79snR79 84 nt0.71□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 NHP2YDL208W 471 nt0.71□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 CDC39YCR093W 6327 nt0.71□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 BI4Q0120 1917 nt0.7□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 APL3YBL037W 3078 nt0.7□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.7□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 COX7YMR256C 183 nt0.7□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 SWS2YNL081C 432 nt0.7□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YPL197CYPL197C 414 nt0.7□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YAR009CYAR009C 3591 nt0.7□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 NUT1YGL151W 3399 nt0.7□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 MPC1YGL080W 393 nt0.69□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YGL109WYGL109W 324 nt0.69□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 TIM10YHR005C-A 282 nt0.69□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YKL111CYKL111C 336 nt0.69□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 IRC23YOR044W 474 nt0.69□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 POP7YBR167C 423 nt0.69□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 ZIP1YDR285W 2628 nt0.68□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YDR521WYDR521W 336 nt0.68□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YHR054CYHR054C 1065 nt0.68□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 LRP1YHR081W 555 nt0.68□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 SAS3YBL052C 2496 nt0.68□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.68□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 NOC3YLR002C 1992 nt0.68□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 SWI5YDR146C 2130 nt0.67□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 SEC1YDR164C 2175 nt0.66□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 snR5snR5 204 nt0.66□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YDL152WYDL152W 366 nt0.66□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.66□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 PAM16YJL104W 450 nt0.66□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 SDS22YKL193C 1017 nt0.66□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 VAM3YOR106W 852 nt0.66□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 MPT5YGL178W 2580 nt0.66□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 TOF2YKR010C 2316 nt0.66□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 UTP13YLR222C 2454 nt0.65□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 AIM9YER080W 1884 nt0.65□□□□□ -2.3
GAL83Q04739 UBP3YER151C 2739 nt0.65□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YDR220CYDR220C 294 nt0.65□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YGL015CYGL015C 393 nt0.65□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.65□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 TMA22YJR014W 597 nt0.65□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YBR012CYBR012C 420 nt0.65□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YOP1YPR028W 543 nt0.65□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 APL2YKL135C 2181 nt0.64□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 AIM44YPL158C 2277 nt0.64□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.64□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YGR228WYGR228W 345 nt0.64□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 CMC4YMR194C-B 222 nt0.64□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.64□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 GPM2YDL021W 936 nt0.63□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 SRP14YDL092W 441 nt0.63□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 CYC7YEL039C 342 nt0.63□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YGR045CYGR045C 363 nt0.63□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 RPL16AYIL133C 600 nt0.63□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YPR096CYPR096C 303 nt0.63□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 PIG1YLR273C 1947 nt0.63□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 CDC24YAL041W 2565 nt0.62□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 HNT1YDL125C 477 nt0.62□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 RPC10YHR143W-A 213 nt0.62□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.62□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YCL002CYCL002C 792 nt0.62□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 RIM20YOR275C 1986 nt0.62□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 NUP157YER105C 4176 nt0.61□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 QCR7YDR529C 384 nt0.61□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YAP3YHL009C 993 nt0.61□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 NBL1YHR199C-A 222 nt0.61□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 NUT2YPR168W 474 nt0.61□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.61□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YLR271WYLR271W 825 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YBR071WYBR071W 636 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YPR099CYPR099C 357 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 SET3YKR029C 2256 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 MKT1YNL085W 2493 nt0.6□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.59□□□□□ -2.31
GAL83Q04739 PAN3YKL025C 2040 nt0.59□□□□□ -2.32
GAL83Q04739 YDL206WYDL206W 2289 nt0.58□□□□□ -2.32
GAL83Q04739 YDR114CYDR114C 303 nt0.58□□□□□ -2.32
GAL83Q04739 YDR509WYDR509W 348 nt0.58□□□□□ -2.32
GAL83Q04739 SCW11YGL028C 1629 nt0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms