Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CREMQ03060 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CREMQ03060 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CREMQ03060 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CREMQ03060 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREMQ03060 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CREMQ03060 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREMQ03060 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREMQ03060 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREMQ03060 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREMQ03060 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREMQ03060 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CREMQ03060 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms