Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
TOP2BQ02880 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TOP2BQ02880 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TOP2BQ02880 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms