Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APBA1Q02410 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APBA1Q02410 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms