Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BEX3Q00994 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms