Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRB1P82279 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRB1P82279 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CRB1P82279 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CRB1P82279 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms