Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CSNK2A1P68400 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSNK2A1P68400 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms