Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNAP25P60880 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNAP25P60880 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms