Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTXN1P60606 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTXN1P60606 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms