Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCL23P55773 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCL23P55773 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCL23P55773 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCL23P55773 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL23P55773 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL23P55773 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL23P55773 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL23P55773 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCL23P55773 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCL23P55773 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCL23P55773 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCL23P55773 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms