Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CRISP3P54108 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CRISP3P54108 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms