Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOSBP53539 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOSBP53539 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOSBP53539 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOSBP53539 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOSBP53539 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOSBP53539 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOSBP53539 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms