Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK4P51957 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK4P51957 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK4P51957 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms