Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP11P51784 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP11P51784 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP11P51784 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP11P51784 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP11P51784 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP11P51784 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms