Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPR4P46093 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPR4P46093 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPR4P46093 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPR4P46093 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPR4P46093 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPR4P46093 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPR4P46093 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPR4P46093 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR4P46093 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR4P46093 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPR4P46093 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms