Protein–RNA interactions for Protein: P40317

SOK1, Protein SOK1, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK1P40317 PAM16YJL104W 450 nt0.89□□□□□ -2.27
SOK1P40317 PRP21YJL203W 843 nt0.89□□□□□ -2.27
SOK1P40317 RPS18BYML026C 441 nt0.89□□□□□ -2.27
SOK1P40317 SWS2YNL081C 432 nt0.89□□□□□ -2.27
SOK1P40317 NUP188YML103C 4968 nt0.89□□□□□ -2.27
SOK1P40317 VPS52YDR484W 1926 nt0.89□□□□□ -2.27
SOK1P40317 KAR3YPR141C 2190 nt0.89□□□□□ -2.27
SOK1P40317 AFR1YDR085C 1863 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 EAF1YDR359C 2949 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 ZRG17YNR039C 1818 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YFL012WYFL012W 447 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YLL020CYLL020C 306 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YOL029CYOL029C 606 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YOR376WYOR376W 369 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YPL197CYPL197C 414 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 COG4YPR105C 2586 nt0.88□□□□□ -2.27
SOK1P40317 SLX9YGR081C 633 nt0.87□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.87□□□□□ -2.27
SOK1P40317 ERP4YOR016C 624 nt0.87□□□□□ -2.27
SOK1P40317 RAD50YNL250W 3939 nt0.86□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.86□□□□□ -2.27
SOK1P40317 RPC10YHR143W-A 213 nt0.86□□□□□ -2.27
SOK1P40317 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.86□□□□□ -2.27
SOK1P40317 NBP1YLR457C 960 nt0.86□□□□□ -2.27
SOK1P40317 CGI121YML036W 546 nt0.86□□□□□ -2.27
SOK1P40317 CDC39YCR093W 6327 nt0.86□□□□□ -2.27
SOK1P40317 PEP3YLR148W 2757 nt0.85□□□□□ -2.27
SOK1P40317 SPR3YGR059W 1539 nt0.85□□□□□ -2.27
SOK1P40317 SGD1YLR336C 2700 nt0.85□□□□□ -2.27
SOK1P40317 snR79snR79 84 nt0.85□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YDL211CYDL211C 1119 nt0.85□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YJR079WYJR079W 330 nt0.85□□□□□ -2.27
SOK1P40317 ABM1YJR108W 372 nt0.85□□□□□ -2.27
SOK1P40317 UTP13YLR222C 2454 nt0.85□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YAR009CYAR009C 3591 nt0.85□□□□□ -2.27
SOK1P40317 NUP145YGL092W 3954 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 CHZ1YER030W 462 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 TMA22YJR014W 597 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 RCN1YKL159C 636 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YLR252WYLR252W 306 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 HHT1YBR010W 411 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 snR14snR14 160 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 PAU24YBR301W 363 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 YCL046WYCL046W 324 nt0.84□□□□□ -2.27
SOK1P40317 PAC1YOR269W 1485 nt0.84□□□□□ -2.28
SOK1P40317 VMA21YGR105W 234 nt0.83□□□□□ -2.28
SOK1P40317 CRG1YHR209W 876 nt0.83□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YKL111CYKL111C 336 nt0.83□□□□□ -2.28
SOK1P40317 UBP3YER151C 2739 nt0.82□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YDL016CYDL016C 303 nt0.82□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.82□□□□□ -2.28
SOK1P40317 PRM8YGL053W 714 nt0.82□□□□□ -2.28
SOK1P40317 SPO13YHR014W 876 nt0.82□□□□□ -2.28
SOK1P40317 SAS3YBL052C 2496 nt0.82□□□□□ -2.28
SOK1P40317 RTR1YER139C 681 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 RPL42BYHR141C 321 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YIL029CYIL029C 429 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 RPL40BYKR094C 387 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 RPL42AYNL162W 321 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 IRC16YPR038W 360 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 SWI4YER111C 3282 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 OSH6YKR003W 1347 nt0.81□□□□□ -2.28
SOK1P40317 STB6YKL072W 2301 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 IES5YER092W 378 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YJR141WYJR141W 1044 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 PAU18YLL064C 363 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 AFB1YLR040C 675 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 GMC2YLR445W 567 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 DDR48YMR173W 1293 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 PAU6YNR076W 363 nt0.8□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YBR184WYBR184W 1572 nt0.79□□□□□ -2.28
SOK1P40317 QCR7YDR529C 384 nt0.79□□□□□ -2.28
SOK1P40317 YKL044WYKL044W 321 nt0.79□□□□□ -2.28
SOK1P40317 UBX4YMR067C 1251 nt0.79□□□□□ -2.28
SOK1P40317 SMB1YER029C 591 nt0.78□□□□□ -2.28
SOK1P40317 RPS30BYOR182C 192 nt0.78□□□□□ -2.28
SOK1P40317 TIM18YOR297C 579 nt0.78□□□□□ -2.28
SOK1P40317 SRP14YDL092W 441 nt0.77□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YDL152WYDL152W 366 nt0.77□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YDR029WYDR029W 315 nt0.77□□□□□ -2.29
SOK1P40317 OCA6YDR067C 675 nt0.77□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YGL217CYGL217C 342 nt0.77□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.77□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.77□□□□□ -2.29
SOK1P40317 YKL123WYKL123W 381 nt0.77□□□□□ -2.29
SOK1P40317 SLX4YLR135W 2247 nt0.77□□□□□ -2.29
SOK1P40317 PRP16YKR086W 3216 nt0.76□□□□□ -2.29
SOK1P40317 SNU56YDR240C 1479 nt0.76□□□□□ -2.29
SOK1P40317 IRC23YOR044W 474 nt0.76□□□□□ -2.29
SOK1P40317 SEC5YDR166C 2916 nt0.76□□□□□ -2.29
SOK1P40317 PPN1YDR452W 2025 nt0.76□□□□□ -2.29
SOK1P40317 INA22YIR024C 651 nt0.75□□□□□ -2.29
SOK1P40317 BER1YLR412W 825 nt0.75□□□□□ -2.29
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