Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GGCXP38435 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GGCXP38435 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GGCXP38435 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GGCXP38435 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GGCXP38435 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GGCXP38435 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms