Protein–RNA interactions for Protein: P36164

TVP38, Golgi apparatus membrane protein TVP38, yeastyeast

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP38P36164 EAF1YDR359C 2949 nt0.98□□□□□ -2.25
TVP38P36164 YGL015CYGL015C 393 nt0.98□□□□□ -2.25
TVP38P36164 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.98□□□□□ -2.25
TVP38P36164 COX7YMR256C 183 nt0.98□□□□□ -2.25
TVP38P36164 YPL197CYPL197C 414 nt0.98□□□□□ -2.25
TVP38P36164 YJR003CYJR003C 1560 nt0.98□□□□□ -2.25
TVP38P36164 AFR1YDR085C 1863 nt0.98□□□□□ -2.25
TVP38P36164 SCC2YDR180W 4482 nt0.98□□□□□ -2.25
TVP38P36164 CGI121YML036W 546 nt0.97□□□□□ -2.25
TVP38P36164 YNL114CYNL114C 372 nt0.97□□□□□ -2.25
TVP38P36164 YPR063CYPR063C 423 nt0.97□□□□□ -2.25
TVP38P36164 PEP3YLR148W 2757 nt0.96□□□□□ -2.25
TVP38P36164 YJR029WYJR029W 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 QCR9YGR183C 201 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YOR376WYOR376W 369 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YPR146CYPR146C 330 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 SNF5YBR289W 2718 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 MMS22YLR320W 4365 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 UTP20YBL004W 7482 nt0.96□□□□□ -2.26
TVP38P36164 DOP1YDR141C 5097 nt0.95□□□□□ -2.26
TVP38P36164 UFD2YDL190C 2886 nt0.95□□□□□ -2.26
TVP38P36164 snR79snR79 84 nt0.95□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.95□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YJR079WYJR079W 330 nt0.95□□□□□ -2.26
TVP38P36164 HHT1YBR010W 411 nt0.95□□□□□ -2.26
TVP38P36164 SGD1YLR336C 2700 nt0.95□□□□□ -2.26
TVP38P36164 SMY1YKL079W 1971 nt0.95□□□□□ -2.26
TVP38P36164 NUP188YML103C 4968 nt0.95□□□□□ -2.26
TVP38P36164 UTP13YLR222C 2454 nt0.94□□□□□ -2.26
TVP38P36164 RCN1YKL159C 636 nt0.94□□□□□ -2.26
TVP38P36164 NBP1YLR457C 960 nt0.94□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YDL211CYDL211C 1119 nt0.93□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.93□□□□□ -2.26
TVP38P36164 EMC5YIL027C 426 nt0.93□□□□□ -2.26
TVP38P36164 ABM1YJR108W 372 nt0.93□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YLR252WYLR252W 306 nt0.93□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.93□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YCL046WYCL046W 324 nt0.93□□□□□ -2.26
TVP38P36164 BUD3YCL014W 4911 nt0.93□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YDL016CYDL016C 303 nt0.92□□□□□ -2.26
TVP38P36164 CHZ1YER030W 462 nt0.92□□□□□ -2.26
TVP38P36164 PRM8YGL053W 714 nt0.92□□□□□ -2.26
TVP38P36164 SPO13YHR014W 876 nt0.92□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YKL111CYKL111C 336 nt0.92□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.92□□□□□ -2.26
TVP38P36164 IRC16YPR038W 360 nt0.92□□□□□ -2.26
TVP38P36164 SEC5YDR166C 2916 nt0.92□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 VMA21YGR105W 234 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 RPL42BYHR141C 321 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 CRG1YHR209W 876 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YIL029CYIL029C 429 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 RPL42AYNL162W 321 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 MSS11YMR164C 2277 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 NUP145YGL092W 3954 nt0.91□□□□□ -2.26
TVP38P36164 OSH6YKR003W 1347 nt0.9□□□□□ -2.26
TVP38P36164 MUK1YPL070W 1839 nt0.9□□□□□ -2.27
TVP38P36164 UBX4YMR067C 1251 nt0.9□□□□□ -2.27
TVP38P36164 ERP4YOR016C 624 nt0.9□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.9□□□□□ -2.27
TVP38P36164 QCR7YDR529C 384 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 IES5YER092W 378 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 SPC1YJR010C-A 285 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YJR141WYJR141W 1044 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YKL044WYKL044W 321 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 RPL40BYKR094C 387 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YLL020CYLL020C 306 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 NUP157YER105C 4176 nt0.89□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YBR184WYBR184W 1572 nt0.88□□□□□ -2.27
TVP38P36164 SMB1YER029C 591 nt0.88□□□□□ -2.27
TVP38P36164 HIT1YJR055W 495 nt0.88□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.88□□□□□ -2.27
TVP38P36164 GMC2YLR445W 567 nt0.88□□□□□ -2.27
TVP38P36164 TIM18YOR297C 579 nt0.88□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YMR160WYMR160W 2451 nt0.88□□□□□ -2.27
TVP38P36164 SNU56YDR240C 1479 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 IFH1YLR223C 3258 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 SRP14YDL092W 441 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YDL152WYDL152W 366 nt0.87□□□□□ -2.27
TVP38P36164 YDR029WYDR029W 315 nt0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.6 ms