Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD13P35453 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD13P35453 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms