Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH5P33151 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDH5P33151 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH5P33151 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH5P33151 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH5P33151 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH5P33151 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH5P33151 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH5P33151 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH5P33151 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH5P33151 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH5P33151 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH5P33151 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH5P33151 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH5P33151 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH5P33151 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH5P33151 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH5P33151 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH5P33151 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms