Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 MGA2YIR033W 3342 nt1.89□□□□□ -2.11
NDI1P32340 DIS3YOL021C 3006 nt1.89□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YDL062WYDL062W 426 nt1.89□□□□□ -2.11
NDI1P32340 HSK3YKL138C-A 210 nt1.89□□□□□ -2.11
NDI1P32340 ISF1YMR081C 1017 nt1.89□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.89□□□□□ -2.11
NDI1P32340 NEO1YIL048W 3456 nt1.89□□□□□ -2.11
NDI1P32340 PAN3YKL025C 2040 nt1.88□□□□□ -2.11
NDI1P32340 AGC1YPR021C 2709 nt1.88□□□□□ -2.11
NDI1P32340 RBK1YCR036W 1002 nt1.88□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YEL057CYEL057C 702 nt1.88□□□□□ -2.11
NDI1P32340 HCH1YNL281W 462 nt1.88□□□□□ -2.11
NDI1P32340 NAM7YMR080C 2916 nt1.88□□□□□ -2.11
NDI1P32340 CFT2YLR115W 2580 nt1.88□□□□□ -2.11
NDI1P32340 IRC20YLR247C 4671 nt1.88□□□□□ -2.11
NDI1P32340 PEP3YLR148W 2757 nt1.87□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.87□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.87□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.87□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.87□□□□□ -2.11
NDI1P32340 RPL32YBL092W 393 nt1.87□□□□□ -2.11
NDI1P32340 SIR4YDR227W 4077 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 SEC31YDL195W 3822 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 TIM13YGR181W 318 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YML003WYML003W 873 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 CGI121YML036W 546 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 PGA1YNL158W 597 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YBL083CYBL083C 426 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 SMY1YKL079W 1971 nt1.86□□□□□ -2.11
NDI1P32340 SEF1YBL066C 3447 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 PET309YLR067C 2898 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 MNL2YLR057W 2550 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 VPS34YLR240W 2628 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 PHS1YJL097W 654 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YKL083WYKL083W 615 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 TMA7YLR262C-A 195 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YBL073WYBL073W 312 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 AIM9YER080W 1884 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 PEX8YGR077C 1770 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YBR184WYBR184W 1572 nt1.85□□□□□ -2.11
NDI1P32340 HCS1YKL017C 2052 nt1.84□□□□□ -2.11
NDI1P32340 TOF2YKR010C 2316 nt1.84□□□□□ -2.11
NDI1P32340 RPA34YJL148W 702 nt1.84□□□□□ -2.11
NDI1P32340 MRPL31YKL138C 396 nt1.84□□□□□ -2.11
NDI1P32340 YAR053WYAR053W 297 nt1.84□□□□□ -2.11
NDI1P32340 IRC23YOR044W 474 nt1.84□□□□□ -2.11
NDI1P32340 ATG11YPR049C 3537 nt1.84□□□□□ -2.12
NDI1P32340 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.83□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YPL225WYPL225W 441 nt1.83□□□□□ -2.12
NDI1P32340 SNF5YBR289W 2718 nt1.82□□□□□ -2.12
NDI1P32340 DNF3YMR162C 4971 nt1.82□□□□□ -2.12
NDI1P32340 MYO4YAL029C 4416 nt1.82□□□□□ -2.12
NDI1P32340 RPH1YER169W 2391 nt1.82□□□□□ -2.12
NDI1P32340 GRR1YJR090C 3456 nt1.82□□□□□ -2.12
NDI1P32340 SLM1YIL105C 2061 nt1.82□□□□□ -2.12
NDI1P32340 PLC1YPL268W 2610 nt1.82□□□□□ -2.12
NDI1P32340 MMS22YLR320W 4365 nt1.82□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YCR043CYCR043C 384 nt1.81□□□□□ -2.12
NDI1P32340 CYB5YNL111C 363 nt1.81□□□□□ -2.12
NDI1P32340 BIL1YOR304C-A 231 nt1.81□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YPL229WYPL229W 621 nt1.81□□□□□ -2.12
NDI1P32340 TUS1YLR425W 3924 nt1.81□□□□□ -2.12
NDI1P32340 GUP1YGL084C 1683 nt1.8□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YDR008CYDR008C 351 nt1.8□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.8□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YAF9YNL107W 681 nt1.8□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.8□□□□□ -2.12
NDI1P32340 BPH1YCR032W 6504 nt1.8□□□□□ -2.12
NDI1P32340 ARP7YPR034W 1434 nt1.8□□□□□ -2.12
NDI1P32340 LRE1YCL051W 1752 nt1.8□□□□□ -2.12
NDI1P32340 VPS15YBR097W 4365 nt1.8□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YNL144CYNL144C 2223 nt1.79□□□□□ -2.12
NDI1P32340 RPL42BYHR141C 321 nt1.79□□□□□ -2.12
NDI1P32340 RPS27AYKL156W 249 nt1.79□□□□□ -2.12
NDI1P32340 RPL40BYKR094C 387 nt1.79□□□□□ -2.12
NDI1P32340 RPL42AYNL162W 321 nt1.79□□□□□ -2.12
NDI1P32340 TIM18YOR297C 579 nt1.79□□□□□ -2.12
NDI1P32340 DFG16YOR030W 1860 nt1.79□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YJR011CYJR011C 786 nt1.78□□□□□ -2.12
NDI1P32340 YNL114CYNL114C 372 nt1.78□□□□□ -2.12
NDI1P32340 PEP1YBL017C 4740 nt1.78□□□□□ -2.12
NDI1P32340 IRR1YIL026C 3453 nt1.78□□□□□ -2.13
NDI1P32340 HSH155YMR288W 2916 nt1.77□□□□□ -2.13
NDI1P32340 ZRG8YER033C 3231 nt1.77□□□□□ -2.13
NDI1P32340 PRE4YFR050C 801 nt1.77□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.77□□□□□ -2.13
NDI1P32340 RTP1YMR185W 2946 nt1.77□□□□□ -2.13
NDI1P32340 PAC1YOR269W 1485 nt1.76□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YJR039WYJR039W 3366 nt1.76□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.76□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YDR102CYDR102C 333 nt1.75□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YKL136WYKL136W 399 nt1.75□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.75□□□□□ -2.13
NDI1P32340 HHT1YBR010W 411 nt1.75□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YHL041WYHL041W 450 nt1.74□□□□□ -2.13
NDI1P32340 ABM1YJR108W 372 nt1.74□□□□□ -2.13
NDI1P32340 MCM22YJR135C 720 nt1.74□□□□□ -2.13
NDI1P32340 SGO1YOR073W 1773 nt1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.5 ms