Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPS1P31327 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPS1P31327 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPS1P31327 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPS1P31327 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CPS1P31327 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPS1P31327 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPS1P31327 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPS1P31327 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CPS1P31327 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPS1P31327 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CPS1P31327 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CPS1P31327 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPS1P31327 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPS1P31327 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPS1P31327 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPS1P31327 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPS1P31327 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CPS1P31327 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CPS1P31327 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CPS1P31327 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPS1P31327 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPS1P31327 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPS1P31327 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPS1P31327 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPS1P31327 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CPS1P31327 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CPS1P31327 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CPS1P31327 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CPS1P31327 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CPS1P31327 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CPS1P31327 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CPS1P31327 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CPS1P31327 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms