Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXC13P31276 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXC13P31276 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms