Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PEX2P28328 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PEX2P28328 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX2P28328 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX2P28328 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX2P28328 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms