Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LMO2P25791 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LMO2P25791 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LMO2P25791 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LMO2P25791 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms