Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD58P19256 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD58P19256 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD58P19256 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD58P19256 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD58P19256 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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