Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPI1P17947 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPI1P17947 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPI1P17947 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms