Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ITGA2P17301 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA2P17301 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms