Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB4P16144 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms