Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM27P14373 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms