Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SKIP12755 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SKIP12755 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SKIP12755 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SKIP12755 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SKIP12755 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SKIP12755 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SKIP12755 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms