Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GLI4P10075 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI4P10075 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI4P10075 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GLI4P10075 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GLI4P10075 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GLI4P10075 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GLI4P10075 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GLI4P10075 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GLI4P10075 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GLI4P10075 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GLI4P10075 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GLI4P10075 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms