Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMIM10L2AP0DMW4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM10L2AP0DMW4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms