Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB1P08034 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GJB1P08034 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB1P08034 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB1P08034 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB1P08034 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms