Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBB4AP04350 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4AP04350 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms